在使用自吸泵保護時，要注意兩點：預先設置一個自吸延時，以保證泵對自吸泵干運轉，低于小流量下運行的自吸泵保護邏輯激活前，自吸泵有足夠的時間完成自吸灌泵：預先設置一個自吸延時的應用邏輯，以甄別泵自吸灌泵的狀態以及在干運行或低于小流量時運行。

變頻器泵的保護不同于定速泵保護。

對于定速泵來說，保護比較簡單，只要檢測小功率(電流)和大功率(電流)就能阻止泵自吸運行到小流量或大流量。

自吸泵變速小流量限流是指在多速情況下，在多個自吸泵的性能曲線上，左端小流量限流(由A、B兩點連接成的線)所形成的限流線所示。水泵變速時大流量限值是由多種轉速下自吸泵在右端的限制點上形成的一條限流線(例如由C,D兩點連接起來)。

很多通用的變頻器都具有監測低負荷、高負荷(功率或電流)的功能，也就是當監測到到某一負荷值(功率或電流)時，會發出警報。這種方法能保護電機，但是對小流量和大流量的調速保護不適用，因為它沒有考慮到離心泵轉速變化與負載(功率或電流)之間的關系。